我々はタマネギBACクローンの有効利用の１つとして、有用遺伝子のゲノム解析を試みている。韓国との共同研究により、タマネギの根で発現している新規アリイナーゼ遺伝子（ALL1）を見出し、そのゲノム構造を明らかにした（Do et al. 2004）。タマネギはゲノムが巨大なために遺伝子密度が低く、遺伝子の周りには複雑な反復配列が存在していた。また、単子葉植物のゲノム構造において、穀類ではGC含量が高いのが特徴であるが、タマネギではGC含量は双子葉植物のシロイヌナズナと同程度であることが分かった。アメリカやニュージーランドとの共同研究で、他のBACクローンのゲノム解析も行っている（Jakse et al. 2008）。



図：タマネギALL1遺伝子領域の物理地図（a）、GC含量（b）、サザンブロット分析（c）

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関連発表

Do, G. S., Suzuki, G., and Mukai, Y. (2002) Isolation of onion BAC clones containing alliinase sequences.　
日本育種学会第101回講演会. 町田. 2002-3-30.

都琴淑・鈴木剛・向井康比己 (2002) タマネギalliinase様遺伝子のゲノム構造解析.　
日本育種学会第102回講演会. 帯広. 2002-8-27.

都琴淑・中塚真衣・増田小百合・鈴木剛・向井康比己 (2003) タマネギalliinase様遺伝子のゲノム構造解析�U. 発現と周辺配列.　
日本育種学会第103回講演会. 千葉. 2003-4-3.

McCallum, J. , Pither-Joyce, M., ,Havey, M.J., Do, G.S., Mukai, Y. and Suzuki, G. (2003) Cloning and Characterization of the Onion Sulfite Reductase Locus.
4th International ISHS Symposium on Edible Alliaceae, Beijing, 2003-4-20...25.

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論文掲載

Do, G.S., Suzuki, G. and Mukai, Y. (2004) Genomic organization of a novel root alliinase gene, ALL1, in onion.
Gene 325: 17-24.

Jakse, J., Meyer, J.D.F., Suzuki, G., McCallum, J., Cheung, F., Town, C.D. and Havey, M.J. (2008) Pilot sequencing of onion genomic DNA reveals fragments of transposable elements, low gene densities, and significant gene enrichment after methyl filtration.
Mol. Genet. Genomics 280: 287-292.